卵巢囊肿是指卵巢内有囊性的肿物形成，可分为肿瘤性和非肿瘤性两类。肿瘤性囊肿即为卵巢肿瘤，非肿瘤性囊肿包括卵巢的功能性囊肿以及子宫内膜异位囊肿。
生育年龄的妇女最容易发生的卵巢囊肿是卵巢的功能性囊肿，它是由于卵巢本身或药物刺激造成的过度生理性反应所致。患者一般没有任何感觉或不适，少数人可能会有月经失调，多因其它原因就医检查时意外发现。卵巢功能性囊肿，直径大多小于5厘米，能够自然消失，一般不需要治疗。
卵巢囊肿的另一常见原因是卵巢肿瘤，可发生于任何年龄，但多见于育龄妇女，是妇科常见肿瘤，约占女性生殖系统肿瘤的三分之一。卵巢恶性肿瘤的死亡率则高居妇科恶性肿瘤的首位，是妇科肿瘤中威胁最大的疾病。卵巢肿瘤的病因不明。同卵巢功能性囊肿一样，早期患者无任何症状，多为体检时意外发现。如果发生肿瘤蒂扭转或破裂，会出现突发性的下腹痛。
卵巢的囊性肿瘤多为良性，但也会恶变。因此，一旦确诊为卵巢肿瘤，应当尽早手术治疗。
卵巢子宫内膜异位囊肿又名卵巢巧克力囊肿，也是较为常见的卵巢囊肿。是由于子宫内膜异位症波及卵巢，在卵巢内形成含有巧克力样粘稠液体的囊肿。肿块的大小不一，大的直径可在10厘米以上。患者常有进行性加重的痛经、性交痛、不孕以及月经失调。妇科检查时盆腔有触痛性结节。卵巢巧克力囊肿的治疗，要根据患者的年龄、囊肿大小、痛经程度、有无生育要求等综合考虑，分别采取药物、保守性手术直至根治性手术治疗。
可见，卵巢囊肿是卵巢囊性肿块的统称，它对于身体的危害以及对它的治疗，取决于它的性质。对30岁以上妇女来说，即使无任何不适，每年都应体格检查一次，包括进行妇科检查。如果发现卵巢囊肿，应进一步检查，明确是功能性、肿瘤性还是子宫内膜异位囊肿，以采取不同的治疗。一般来说，如囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤的话，多为功能性囊肿，可以密切随访，即2-3个月检查一次，以后再根据情况调整检查间隔时间；若囊肿直径大于5厘米，则多为卵巢肿瘤，一般需要手术治疗；如果同时伴有进行性加重的痛经及性交痛、盆腔有触痛性结节，则应考虑子宫内膜异位囊肿，可根据具体情况，采取不同的治疗。
